Jonathan Borja es motivo de conflicto en el club Always Ready de Bolivia ya que no cuenta con el respaldo de nadie, así lo dio a conocer el presidente del equipo en el diario Página Siete de ese país.
Andrés Costa, mandamás del club, expresó: "El problema de Borja pasa por las actitudes que ha tenido con el plantel, me han llamado jugadores también expresándome que no forma parte del grupo, que se sale, que no entra a los entrenamientos", dijo.
Recalcó que Borja ha sido llamado a entrenar en reservas, pero que el jugador no ha acudido.
Además fue más allá en informar la incomodidad con Borja: "Tiene un problema de relacionamiento con los jugadores, entonces es muy difícil, yo lo he respaldado a Borja, pero es complicado, he querido analizar bien la información, hablé con el plantel y el tema es que son 40 contra uno y todos me dan la misma información, que Borja está mal, que no saluda, no contesta a nadie y el psicólogo dice que no tiene ganas de nada, y no sé", manifestó Costa.